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A. Ciências Exatas e da Terra - 2. Ciência da Computação - 17. Ciência da Computação
DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS PARA O PROJETO GENOMA FUNCIONAL E DIFERENCIAL DO Paracoccidiodes brasiliensis.
Daniel Arruda Santos Anjos 1, Maria Emíllia Machado Telles Walter 1, Edans Flávius de Oliveira Sandes 1, Marcus Kiyoshi Inoue 1, Luiz Gustavo Horita 1 e Maria José de Albuquerque Carvalho 2
1- Departamento de Ciência da Computação – UnB - daniels@unb.br 2- Departamento de Biologia Celular – UnB - mia@cic.unb.br , UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA - UNB
O projeto Genoma Funcional e Diferencial do P. brasiliensis (Projeto Genoma Pb), que integra a Rede Genoma Centro-Oeste, tem como objetivo geral o mapeamento do genoma funcional e diferencial entre as formas de micélio e levedura de P. brasiliensis. Seus objetivos específicos incluem a qualificação de recursos humanos nas áreas de Biotecnologia e Bioinformática e o aprimoramento da infra-estrutura dos laboratórios para projetos em rede, agregando grupos de pesquisa em genômica da região Centro-Oeste. Este trabalho foi desenvolvido no Laboratório de Bioinformática da Rede Genoma Centro-Oeste, dando continuidade ao trabalho proposto em 2002. Realizamos a manutenção e o desenvolvimento de novas aplicações para o sistema do Projeto Genoma Pb. Além disso, iniciamos dois novos sistemas - Projeto Guaraná (Projeto Genoma Funcional e Genética Genômica de Paullinia cupana) e Projeto Anaplasma (Análise Genômica Estrutural de Anaplasma marginale). No Projeto Genoma Pb, a fase de montagem de 19718 seqüências biológicas forneceu os resultados: 16351 seqüências agrupadas (2655 contigs) e 3367 não agrupadas. Criamos programas para diversas análises dos resultados obtidos da fase de anotação do projeto, e realizamos a manutenção e aprimoramento das ferramentas de anotação automática. Para os projetos Guaraná e Anaplasma, desenvolvemos as etapas de submissão, montagem e anotação, utilizando programação orientada a objetos, banco de dados e padrões de arquivos. Foram submetidas 3939 seqüências no Projeto Guaraná e 1150 seqüências no Projeto Anaplasma (dados de julho/2004). O trabalho desenvolvido neste projeto apóia a consolidação do Laboratório de Bioinformática da Rede Genoma Centro-Oeste, visando cumprir os objetivos de qualificação de recursos humanos em Bioinformática e de melhorias na infra-estrutura dos laboratórios para projetos em rede, agregando grupos de pesquisa do Centro-Oeste. Foram iniciados também sistemas de bioinformática para os Projetos Genoma Guaraná e Anaplasma.
Instituição de fomento: CNPq
Trabalho de Iniciação Científica
Palavras-chave:  Bioinformática; Seqüenciamento de genoma; Paracoccidioides Brasiliensis

Anais da 57ª Reunião Anual da SBPC - Fortaleza, CE - Julho/2005