As flores monoclinas, aclamídeas, unipistiladas e tetraestaminadas encontram-se dispostas em inflorescências do tipo espiga e são protegidas por uma bráctea. O eixo da inflorescência apresenta estrutura caulinar. Em Piper arboreum, o eixo da infrutescência se mantém semelhante ao eixo da inflorescência, no entanto, em Piper gaudichaudianum, o córtex aumenta de espessura devido a divisões celulares peri e anticlinais, seguidas de um alongamento radial. Nessa região também verificou-se grande acúmulo de amido. O gineceu apresenta 2-4 lobos e estilete fendilhado em Piper arboreum e 3 lobos com estilete sólido em Piper gaudichaudianum. A epiderme externa ovariana pouco se altera com o desenvolvimento do fruto, se tornando o exocarpo. No mesofilo, observa-se 2-3 estratos celulares que iniciam divisões periclinais, formando, no mesocarpo, um meristema ventral, que chega a formar apenas 2-3 camadas de células, dividindo o mesocarpo em interno e externo. A epiderme interna ovariana é glabra nas duas espécies, com células secretoras e amplas apenas em Piper arboreum, e o endocarpo se comprime conforme o desenvolvimento do fruto, mas não foi observado esclerificação durante o amadurecimento do fruto e da semente. O óvulo é reto ou ortótropo, crassinucelado e bitegumentado. A semente é endotégmica, perispérmica e apresenta reserva amilácea. O embrião, de ambas as espécies, apresenta-se muito reduzido e há resíduos de endosperma na região micropilar.