As amostras foram coletadas da água superficial (até 50 cm de profundidade) ao longo de 11 (onze) pontos fixos de coleta, cobrindo toda a extensão do estuário (aproximadamente 24 quilômetros), em duas campanhas de campo, de fevereiro a setembro de 2004, e de fevereiro a agosto de 2005. Os valores da salinidade foram coletados em maré cheia e maré vazante, já as demais variáveis apenas na maré cheia, a partir da foz do referido rio, adentrando no estuário por mais dez pontos, visando o acompanhamento geral das variações destes fatores. As medições dos valores da salinidade foram realizadas diariamente com um refratômetro (Fisher), cuja medida de valor é dada em graus Baumé (ºBé), onde 1 ºBé corresponde a 10g.l^-1. Os valores do pH e temperatura da água foram medidos in situ com um pHmetro / termômetro digital (HI 8314 membrene pHmeter), e a transparência da água foi obtida através do disco de Secchi. Quanto ao método das análises dos nutrientes, as análises do nitrato foram realizadas nos métodos descritos no Standard Methods (1998); as do nitrito foram realizadas como descrito em Mackeret et al. (1978); e o fosfato pelo método do fosfovanadomolibdato, descrito em Vogel (1989). As amostras foram coletadas em garrafas de 1 litro, previamente lavadas com água deionizada, e acondicionadas  em um isopor com gelo. Todas as tabelas e gráficos, assim como o tratamento destes foram realizados no programa Microsoft Excel XP.

A partir das análises realizadas, observou-se uma variação periódica em todos os aspectos analisados, tendo como maior destaque a variável salinidade, apresentando uma variação diária entre 0 e 3.6 ºBé (fevereiro a maio) e 3,3 a 7 ºBé (junho a setembro). Comparando os valores da salinidade com todas a variáveis, verificou-se que a redução deste fator implicou na elevação das concentrações dos nutrientes, caracterizando-se uma relação inversamente proporcional, onde a salinidade atua como um regulador natural das concentrações destes. Para salinidades entre 4 e 6 ºBé, os valores do nitrato, oscilaram entre 0 e 0,01 μg/l, e de 0,05 a 0,15 μg/l em salinidades de 1 a 2 ºBé. Os valores dos nitritos variaram entre 0,08 e 0,55 μg/l em salinidades de 6 e 0 ºBé, respectivamente. O fosfato apresentou uma variação de 0,0 a 0,02 μg/l com salinidades entre 0,0 e 3,6 ºBé em 2004; e 0,02 a 0,15 μg/l com salinidades entre 3,6 a 6 ºBé em 2005, chegando-se a estes últimos valores apenas no final da zona considerada como de influência da salinidade (0,0 - 2,5 ºBé).  A temperatura da água permaneceu praticamente constante, entre 27 e 30º C, com picos de 32º. Tanto a transparência e quanto o pH da água não apresentaram relação direta com a salinidade e sim com a quantidade de matéria em suspensão na água, onde o pH variou entre 7,7 e 8,6, e a transparência entre 20 e 110 cm (este último valor encontrado apenas na foz do estuário).

De acordo com os valores mostrados acima, pode-se observar que existe uma dinâmica interna de nutrientes e demais fatores físico-químicos no estuário do rio Mossoró/RN, relacionados entre si e principalmente com as concentrações de cloreto de sódio (NaCl) dissolvidos no meio. Como base nessa análise, a pesquisa identificou que o ambiente estudado se trata de um estuário negativo (MARGALEF, 1978), onde a água do oceano entra com uma força maior em relação à do rio, fazendo com que esta se concentre no interior do estuário. Somando-se com a intensa evaporação, ventos constantes e altas temperaturas durante a maior parte do ano, esse ambiente se torna hipersalino, atribuindo-lhe esta caracterização talvez única em todo o país. Os fatores analisados apresentaram uma variação espaço-temporal na camada superficial da água no decorrer de toda pesquisa (fevereiro – setembro/2004 e fevereiro – agosto/2005), com alterações mais bruscas nos valores na medida em que se adentra no estuário, sendo o fator salinidade o de maior influência sobre os outros. Ao serem observados os gráficos comparativos entre a salinidade e os outros fatores, identificou-se que esta variável exerce uma influência inversamente proporcional sobre estes, atuando como um regulador das concentrações de nutrientes na água do estuário.