C. Ciências Biológicas - 8. Genética - 4. Genética Molecular
ANÁLISE DA DIVERSIDADE GENÉTICA ENTRE AS CEPAS DM28 (T. CRUZI I) E CL BRENER (T. CRUZI II) ATRAVÉS DA COMPARAÇÃO DE SEQUÊNCIAS GÊNICAS: UM ENFOQUE EVOLUTIVO
Rafael Luis Kessler1 Christian Macagnan Probst1 Marco Aurelio Krieger1
1. 1. Instituto Carlos Chagas/ICC
INTRODUÇÃO:Atualmente o grupo do IBMP está desenvolvendo um programa de Genômica Estrutural do Trypanosoma cruzi, de forma a permitir que, a partir dos dados de estrutura cristalográfica das proteínas hipotéticas ou hipotéticas conservadas, se possa determinar a função destas proteínas. Diversos genes tidos como diferencialmente expressos na metaciclogênese, através de experimentos de microarranjo, foram selecionados para o presente trabalho. Tendo em vista a presença de duas linhagens principais em T. cruzi, genotipica e fisiologicamente distintas, e as diferenças entre a cepa utilizada por nós, Dm28c (T. cruzi I), e a cepa da qual se obteve o genoma de T. cruzi, CL Brener (T. cruzi II), é necessário a comprovação da seqüência de todos os genes utilizados no Projeto Genômica Estrutural de T. Cruzi para que possamos saber a correta seqüência de aminoácidos nas proteínas que desejamos estudar. Assim sendo, o presente trabalho teve como objetivo seqüenciar os 192 genes selecionados para o Projeto Genômica Estrutural de T. cruzi, utilizando o clone Dm28c, e comparar as seqüências obtidas com os dados fornecidos pelo Projeto Genoma de T. cruzi para o clone CL Brener, em nível gênico e protéico.METODOLOGIA:Os genes foram amplificados por PCR, purificados e sequenciados por amplificação com nucleotídeos terminadores de cadeia seguido de análise das sequências num sequenciador automático ABI PRISM - 3100 Genetic Analizer. As seqüências obtidas para os 192 genes foram analisadas no programa Phred-Phrap-Consed, e alinhadas com órtologos de T. cruzi (cepa CLBrener), T. brucei e Leishmania major nos programas ClustalW e DIALIGN. As análises filogenéticas foram realizadas com ajuda do programa DNADist (método de distância) presente no pacote PHYLIP (“PHYlogeny Inference Package”). As árvores filogenéticas produzidas foram visualizadas com ajuda do programa TreeView.RESULTADOS:Observou-se três padrões distintos de alinhamentos: genes únicos de T. cruzi; genes com um ortólogo em T. cruzi e somente um ortólogo em T. brucei e L. major; genes com diversos ortólogos em T. cruzi, T. brucei e L. major, as famílias gênicas. Devido a expressão diferencial destas proteínas hipotéticas durante a metaciclogênese de T. cruzi, diferentes funções específicas podem ser atribuídas a cada um destes três grupos de genes de acordo com padrões evolutivos dos mesmos.CONCLUSÕES:Os alinhamentos gênicos e protéicos com genomas de Tritryps corroboram estudos filogenéticos prévios que demonstram o relacionamento evolutivo entre tais tripanossomatídeos, além de reafirmarem a presença de duas linhagens distintas em T. cruzi. O presente trabalho também demonstra que o genoma da cepa referência CL Brener não cobre a grande diversidade intra-específica de T. cruzi.
Trabalho de Iniciação Científica
Palavras-chave: Trypanosoma cruzi, linhagens, diversidade
E-mail para contato: polacokessler@hotmail.com
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