O entendimento e a interpretação da biodegradação é um dos principais assuntos na indústria do petróleo, uma vez que este processo afeta diretamente a qualidade do óleo bruto. Ela modifica as propriedades físicas e químicas do óleo, o que tem um impacto direto sobre os processos de transporte e refino. Muitos estudos sobre esse assunto, incluindo uma avaliação sobre as condições químicas, físicas e geológicas dos processos de biodegradação, já foram feitos anteriormente.

A biodegradação afeta a composição relativa dos biomarcadores nos óleos, o que dificulta a caracterização e avaliação dos parâmetros relacionados à origem, à evolução térmica e à migração.

Em óleos biodegradados ou em misturas de óleos biodegradados e não-biodegradados, o aumento de compostos NSO e a presença de UCM's, modificam as características cromatográficas, o teor de enxofre, a gravidade API e outros parâmetros, dificultando a identificação dos componentes biodegradados.

Para obtenção dos biomarcadores saturados e aromáticos, estritamente de caráter neutro, os óleos foram submetidos a colunas cromatográficas sendo eluídas com hexano (Fração F1), hexano:tolueno (3:2, Fração F2) e tolueno:metanol (3:2, Fração F3). Em seguida, a fração hexânica (F1) foi cromatografada em placa preparativa (CPP) impregnada com AgNO₃ 5% e separada em fração saturada (F1P1) e fração aromática (F1P2).

As amostras de óleos foram analisadas no sistema GC-MS (GC-17A/MS-QP5050A, SHIMADZU), após tratamento cromatográfico adequado. Para cromatografia dos componentes foi empregada coluna DB-5HT, 30 m × 0,25 mm, espessura do filme interno de 0,10 µm e Hélio como gás carreador (1.0 mL/min.). A temperatura da interface foi 310 °C; a do o injetor, 300 °C; a temperatura inicial, 70 °C por 2 min. com rampa de aquecimento de 10 °C/min. até 310 °C por 10 min.

Os cromatogramas da fração neutra mostraram que as três amostras de óleo estão bem preservadas, como indicado pela presença de toda uma série n-alcanos. A análise por CG-EM mostrou valores para razão hopano/esterano de 1,76; 2,27 e 2,34 para os óleos A, B e C, respectivamente; pristano/fitano (P/F)≤0,82; Ts/(Ts+Tm)<0,5 e a presença de β-caroteno. A razão Ts/(Ts+Tm), e as razões C₂₇ e C₂₉ 20S/(20S+20R) C₂₉ αββ/(αββ+ααα) esteranos e os índices metilfenantrenos (MPI-1, MPI-2, MPI-3 e 2-MP/1-MP) mostram similares valores para os óleos, indicando similar evolução térmica.

O RIC m/z 365 mostrou uma série de compostos 8,14-secohopanos monoaromáticos de C₂₇ a C₃₀, com predominância de C₂₉ e C₃₀. Sua ocorrência em óleos biodegradados sugerem que esses compostos são altamente biorresistentes. Porém, esses compostos podem ocorrer, também, em óleos não-biodegradados, o que sugere que podem ter um precursor biológico direto ou serem formados durante o início da diagênese.