A metodologia consiste na elaboração e aplicação de ferramentas pedagógicas pelos discentes monitores. Desta forma, a metodologia foi aplicada em três fases. A primeira foi a elaboração das ferramentas pedagógicas pelos monitores através de pesquisas bibliográficas seguido da seleção dos temas a serem abordados. Neste momento os monitores delinearam um projeto de ação que continham os requisitos básicos de um projeto, tais como: introdução, objetivos, metodologia e referências. A segunda fase consistiu na aplicação da ferramenta pedagógica na turma pelos monitores, estando estes no comando das ações, mas obrigatoriamente supervisionados e orientados pelo docente responsável. A terceira e última fase consistiu na avaliação da metodologia aplicada pelos monitores feita pelos alunos da disciplina (avaliação foi feita através de questionário com perguntas fechadas e abertas).

A ferramenta pedagógica teve como tema: "Química de macromoléculas: pensando e interagindo". Os alunos do curso de farmácia, em grupos, tiveram a oportunidade de construir, com colagem, a estrutura das macromoléculas, a partir dos seus átomos constituintes, relacionando com a função de cada uma nos seres vivos. A aceitação da ferramenta pelos alunos foi de 100%. O grau de dificuldade para a execução foi considerado médio por 82% dos alunos. Quase 90% consideraram a ferramenta aplicada como altamente relacionada com as aulas teóricas e 82% consideraram esta forma de aprendizagem como mais significativa do que as exposições dialógicas. A atuação dos monitores foi considerada ótima por 80% dos alunos. A preparação profissional no Ensino Superior tem requerido do sujeito que por aí passa muito mais do que acúmulo de informações, dada a realidade repleta de problemas e incertezas com que se defronta na sociedade atual. De forma similar aos outros graus de ensino, o superior utiliza conceitos a partir de provas escritas, não permitindo a reorganização da aprendizagem dos conteúdos e o modo de ensinar continua focado no modelo tradicional. A atuação diferenciada dos monitores na disciplina tenta uma forma diferenciada de ensino, focada no aluno e na sua aprendizagem.

A elaboração e execução da ferramenta pedagógica nos projetos de monitoria (iniciação à docência) mostraram-se válidas e contribuíram de forma significativa para a evolução do processo de ensino-aprendizagem na disciplina de bioquímica, mesmo tendo sido aplicada só uma das quatro previstas para o semestre letivo. Os alunos se mostraram mais motivados, o que refletiu na ótima avaliação do trabalho. Nosso projeto de monitoria mostrou que tanto o domínio do conteúdo científico quanto o processo pedagógico envolvido no ensinar e no aprender são importantes. Daí a necessidade de centrar esforços no ensino-aprendizagem, refletindo e agindo sobre ele.